In 1578 ontstond de Hervormde Gemeente Rijnsburg (voorheen de NederduitsGereformeerde gemeente). Eind 1839 verzette een aantal Hervormde leden zich tegen de van staatswege opgelegde evangelische gezangen en werd de Gereformeerde Kerk Rijnsburg (voorheen de Christelijke Afgescheiden Gemeente van Rijnsburg) gesticht. Per 28 december 2017 hebben de beide gemeenten zich herenigd in de Protestantse Gemeente te Rijnsburg.